BioLab – Analyse Biomédicale pour la Prédiction de la Rechute

Projet de Data Science & Machine Learning (2025)

Ce projet propose une analyse complète d’un jeu de données biomédical synthétique, inspiré des problématiques de recherche en oncologie (biomarqueurs, volume tumoral, évolution sous radiothérapie).
L’objectif est de prédire la rechute dans les 12 mois à partir de données biologiques et cliniques.

Ce type de pipeline est couramment utilisé en recherche biomédicale et en IA appliquée à la santé.

Structure du projet

biolab_project/
├── data/
│   └── biolab_dataset.csv          
├── notebooks/
│   └── 01_exploration_biolab.ipynb 
└── src/
    └── biolab/
        ├── config.py
        ├── data.py
        ├── features.py
        ├── models.py
        ├── train.py
        ├── utils.py
        └── models/
            └── best_model.joblib

Installation

python -m venv .venv
source .venv/bin/activate
pip install -r requirements.txt

Entraîner les modèles

python -m biolab.train

Notebook d’analyse

• distributions biologiques
• heatmap
• PCA
• comparaison de modèles

Technologies

Python, pandas, numpy, scikit-learn, matplotlib, seaborn, joblib

Auteur

Ines Amirat — Master 2 Génie Logiciel